Aktuell gibt es im Grunde zwei Minecraft Versionen, die klassische Minecraft Java Version, und die neuere "Bedrock" Edition, welche für alle Konsolen/Smartphones/usw. adaptiert wurde (und auch unter Windows 10 läuft, diese kann man sich als Minecraft Java Edition Besitzer kostenlos im Windows 10 Store herunterladen).
Leider sind diese Spiele in ihrer Mechanik häufig noch recht verschieden. Es gibt bereits einige Projekte, die es versuchen, Kompatibilität herzustellen, sodass eben auch Minecraft Bedrock Edition Spieler auf einen Minecraft Java Edition Server betreten können (Halfminer ist letzteres). Diese Projekte sind aber leider unfertig, und das Spielerlebnis ist noch sehr eingeschränkt (abgesehen von all den Problemen mit den Anticheat Systemen, aufgrund von verschiedener Bewegung in der Bedrock Edition).
Vielleicht ist es eines Tages möglich, aktuell aber leider noch nicht.
Minispiel Server, wie Mineplex, handhaben das so, dass es zwei separate Server für Java Edition und Bedrock Edition gibt. Diese enthalten dabei aber jeweils auch andere Spiele, da die Software jeweils für die Bedrock Edition angepasst werden muss.